Eskişehir-Alpu geçici sularında bulunan Triops Cancriformis'in (Branchiopoda : Notostraca) 18S rRNA geni ile filogenetik analizi

Abstract

Son yıllarda canlıların sınıflandırılmasında filogenetik çalışmalar öne çıkmıştır. Bu ilişkilerin ortaya konmasında belirli genler ve proteinler evrimsel kronometreler kabul edilerek evrimsel değişimler ölçülmeye çalışılmaktadır. Bu kronometreler arasında en yaygın olanı ribozomal RNA’lardır. Ökaryotlarda dizileme çalışmaları, işlevsel olarak benzer fakat biraz daha büyük 18S molekülü üzerinde odaklanmıştır. Bu çalışmanın materyali Triops cancriformis’in literatürde 18S rRNA geniyle ilgili yapılmış fakat tamamlanmamış iki çalışması bulunmaktadır. Yapılan dizileme sonucunda bu çalışmada elde edilen genin 18S rRNA geni olduğu belirlenmiştir. Gen bankasında T. cancriformis 18S rRNA genine ait dizi bilgileri ile karşılaştırıldığında türün T. cancriformis türü olduğu; bir örneğe ait okunan 650 bazlık dizisinin % 81 oranında, diğer örneğe ait 480 bazlık dizinin ise % 78 oranında benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir. Buradaki farklılığın sebebi 18S rRNA genin uzunluğu 1800 bç olup bu çalışmada ise sadece belirli sayıdaki nükleotit diziliminin belirlenmesidir. Dizi analizi sonuçları karşılaştırıldığında 18S rRNA geninin yüksek oranda korunduğu görülmektedir.Elde edilen verilere göre oluşturulan filogenetik ağaçlar arasında da büyük benzerlik, dolayısıyla familya türleri arasındaki filogenetik akrabalık açıkça görülmektedir.